Le Ministère est représenté au niveau des régions par les délégations régionales conformément au DECRET N°0609/PR/PM/SGG/2016 du 31 août 2016.
En ce qui concerne le réseau routier, sa répartition suivant les délégations régionales fait l'objet d'un arrêté du Ministre des Infrastructures, des Transports et du Désenclavement.
Les activités liées au transport de surface du Ministre des Infrastructures, des Transports et du Désenclavement dans la commune de N’Djaména sont assurées par les services centraux.